Die Mitarbeitenden der GKD unterstützen die Kirchgemeinden in allen Aufgabenfeldern und für alle Berufsgruppen durch Ausbildung, Beratung, Coachung und Support. Zudem ergänzen sie die Kirche in übergemeindlichem Sinn: zum Beispiel in der Bahnhof- und der Flughafenkirche, in der Gefängnis-, Spital- und Notfallseelsorge, an den Mittelschulen, mit Theologiekursen oder mit Bildungsangeboten im Kloster Kappel oder mit diakonischen Schwerpunkten wie der kirchlichen Fachstelle bei Arbeitslosigkeit (DFA).
Durch diese Arbeit ermöglichen die GKD Menschen mit grösserer Distanz zur Kirche eine andere Nähe und tragen dazu bei, dass die Kirche mit anderen Teilen der Gesellschaft im Gespräch bleibt und «ihren Dienst in Offenheit gegenüber der ganzen Gesellschaft» leistet.
Der Kirchenratsschreiber und die Abteilungsleitungen bilden zusammen die Geschäftsleitung.